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data/doc/Info.txt

@@ -3,7 +3,7 @@ Ligne de commande :
 
 	-d -simDuration 8760 -observers data/input/observersCharts.xml -groups data/input/fishLight.xml -env data/input/grid.xml
 
-					-d				: mode débug (affiche message erreus, avertissements...)
+					-d				: mode débug (affiche message erreurs, avertissements...)
 					-simDuration	: nombre de pas de la simulation (8760 = 1an pour un pas horaire)
 					-observers		: fichier d'initialisation des observeurs
 					-groups			: fichier d'initialisation des groupes et process

data/input/observersCharts.xml

@@ -28,7 +28,9 @@
                     </textColor>
                     <margin>0</margin>
                     <hsiMaxValueThreshold>0.5</hsiMaxValueThreshold>        			
+                    
                 </pikelake.environment.Movement2DWithinShapeObserver>
+                
                 <fr.cemagref.observation.observers.jfreechart.TemporalSerieChart>
                     <graphType>LINE</graphType>
                     <title>Biomass</title>

src/main/java/pikelake/Marnage.java

@@ -14,18 +14,17 @@ import fr.cemagref.simaqualife.kernel.processes.AquaNismsGroupProcess;
 
 /**
  *		Classe qui met a jour les cellules accessibles du lac, ainsi que leurs HSI
- *		en fonction du marnage calcule par la classe FichierMarnage
+ *		en fonction du marnage horaire donne par la classe FichierMarnage
  *		@author Guillaume GARBAY
  *		@version 1.0
  */
 public class Marnage extends AquaNismsGroupProcess<Pike,PikesGroup> {
 
 	public static String marnageOld = null, marnageNew = null;
-	public static String saison = "";
 
 	/**
-	 *		MAJ de la grille, augmentation ou diminution du nombre de cellules accessibles
-	 *		Modification du HSI de chaque cellule 
+	 *		Teste si la cote du lac est modifiee, si oui
+	 *		MAJ de la grille et du du HSI de chaque cellule 
 	 *		@param object Represente les individus
 	 *		@return /
 	 */	
@@ -57,7 +56,6 @@ public class Marnage extends AquaNismsGroupProcess<Pike,PikesGroup> {
 		double hsiStd = 0, hsiMoy = 0;
 		int idCell = 0, yPike = 0, xPike = 0;
 		marnageOld = marnageNew;
-		saison = Time.getSeason();
 		
 	    // Initialisation de toute la grille avec hsi = -1
 	    for (int cptCell = 0; cptCell < (grid.getGridWidth() * grid.getGridHeight() - 1); cptCell++)

src/main/java/pikelake/SaveLocation.java

@@ -12,7 +12,7 @@ import fr.cemagref.simaqualife.kernel.processes.AquaNismsGroupProcess;
 
 /**
  *		Classe qui sauvegarde la position des individus a la fin de la simulation
- *		Les positions ainsi que la date correspondant a chacune est enregistre dans des tableaux
+ *		Les positions ainsi que la date correspondant a chacune est enregistre dans un fichier de sortie
  *		
  *		Extrait du fichier de sortie :
  *		PasTps 		 Date 		Ind 1 	Ind 2 	Ind 3 	Ind 4 	Ind 5 	Ind 6 	Ind 7 	...

src/main/java/pikelake/environment/FichierMarnage.java

 package pikelake.environment;
 
 import java.io.File;
-import java.io.FileNotFoundException;
 import java.util.Scanner;
+import java.io.FileNotFoundException;
 
 import pikelake.pikes.Pike;
 import pikelake.pikes.PikesGroup;
@@ -11,7 +11,7 @@ import fr.cemagref.simaqualife.kernel.processes.AquaNismsGroupProcess;
 
 /**
  *		Classe qui lit le fichier contenant le marnage du lac
- *		Ces valeurs sont rangés a l'initialisation dans un talbeau pour un acces plus rapide
+ *		Ces valeurs sont rangees a l'initialisation dans un tableau pour un acces plus rapide
  *		@author Guillaume GARBAY
  *		@version 1.0
  */

src/main/java/pikelake/environment/HoraireLeverCoucher.java

@@ -84,10 +84,10 @@ public class HoraireLeverCoucher extends AquaNismsGroupProcess<Pike,PikesGroup>
 	 *		@param jour Entier contenant le jour
 	 *		@param mois Entier contenant le mois
 	 *		@param heure Entier contenant l'heure
-	 *		@return phaseJournee[jour][mois+1][heure] Chaine de caractère contenant la phase du jour
+	 *		@return phaseJournee[jour][mois][heure] Chaine de caractère contenant la phase du jour
 	 */
 	public static String getPhase (int jour, int mois, int heure) {
-		return phaseJournee[jour][mois+1][heure];
+		return phaseJournee[jour][mois][heure];
 	}
 	
 	/**

src/main/java/pikelake/environment/Movement2DWithinShapeObserver.java

@@ -120,36 +120,6 @@ public class Movement2DWithinShapeObserver extends ObserverListener implements C
         display.setVisible(false);
         display.setDoubleBuffered(true);
 
-/*        grid = (Grid)pilot.getAquaticWorld().getEnvironment();
-
-        System.out.println(grid);
-        // init display variables
-        displayWidthBak = 0;
-        displayHeightBak = 0;
-        // compute HabitatQuality colors
-    	double cellsHabitatQualityMin = 0;
-        double cellsHabitatQualityMax = 0;
-    	cellsAlpha = new int[grid.getCells().length];
-    	if (grid.getCells().length > 0) {
-	    	cellsHabitatQualityMin = grid.getCells()[0].getHabitatQuality();
-	    	cellsHabitatQualityMax = grid.getCells()[0].getHabitatQuality();
-	    	for (int i = 1; i < grid.getCells().length; i++) {
-	    		if (grid.getCells()[i].getHabitatQuality() < cellsHabitatQualityMin)
-	    			cellsHabitatQualityMin = grid.getCells()[i].getHabitatQuality();
-	    		else if (grid.getCells()[i].getHabitatQuality() > cellsHabitatQualityMax)
-	    			cellsHabitatQualityMax = grid.getCells()[i].getHabitatQuality();
-	    	}
-    	}
-    	if (Double.compare(cellsHabitatQualityMax,cellsHabitatQualityMin) == 0) {
-    		for (int i = 0; i < grid.getCells().length; i++) {
-	    		cellsAlpha[i] = 255;
-	    	}
-    	} else {
-	    	for (int i = 0; i < grid.getCells().length; i++) {
-	    		cellsAlpha[i] = (int)(155 + 100*(grid.getCells()[i].getHabitatQuality() - cellsHabitatQualityMin)/(cellsHabitatQualityMax - cellsHabitatQualityMin));
-	    	}
-    	}
-*/
 
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////        
         File file = new File("data/input/shape/513_5.shp");

src/main/java/pikelake/environment/Time.java

@@ -83,7 +83,7 @@ public class Time extends AquaNismsGroupProcess<Pike,PikesGroup> {
 		}
 		
 		/**
-		 *		Détermine la saison en fonction du mois et du jour par mois
+		 *		Détermine la saison en fonction du mois et du jour du mois
 		 *		@param / 
 		 *		@return /
 		 */
@@ -118,7 +118,7 @@ public class Time extends AquaNismsGroupProcess<Pike,PikesGroup> {
 		 *		@param / 
 		 *		@return Season[i] Chaine de caractère contenant la saison
 		 */
-		public static String getSeason() {
+		public static String getSeason () {
 			return Season.values()[saison].toString();
 		}
 }