From cf88db3b5f5ec310e21f1011fe15b19023970b4e Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Samuel Westrelin <samuel.westrelin@irstea.fr>
Date: Fri, 18 Sep 2015 10:01:34 +0000
Subject: [PATCH]
---
src/main/java/pikelake/Grid.java | 569 ++++++++++++++++++-------------
1 file changed, 326 insertions(+), 243 deletions(-)
diff --git a/src/main/java/pikelake/Grid.java b/src/main/java/pikelake/Grid.java
index 29975fc..cda5a4a 100644
--- a/src/main/java/pikelake/Grid.java
+++ b/src/main/java/pikelake/Grid.java
@@ -1,243 +1,326 @@
-package pikelake;
-
-import java.io.File;
-import java.util.List;
-import java.util.Scanner;
-import java.util.ArrayList;
-import java.util.StringTokenizer;
-import java.io.FileNotFoundException;
-
-import pikelake.Cell;
-import pikelake.pikes.Pike;
-import pikelake.environment.Time;
-import pikelake.environment.AreaMovement;
-import pikelake.environment.FichierMarnage;
-
-import fr.cemagref.simaqualife.pilot.Pilot;
-import fr.cemagref.simaqualife.kernel.AquaNismsGroup;
-import fr.cemagref.simaqualife.extensions.spatial2D.Grid2D;
-import fr.cemagref.simaqualife.kernel.util.TransientParameters.InitTransientParameters;
-
-/**
- * Classe qui initialise la grille de la simulation (lac et cellule non accessible)
- * @author Guillaume GARBAY
- * @version 1.0
- */
-public class Grid extends Grid2D<Cell, Individual> {
-
- private String marnageInit = "513_4";
-
- /**
- * Constructeur de la classe Grid
- * @param gridWidth Largeur totale de la grille
- * @param gridHeight Longueur totale de la grille
- * @param neighborsType Type de voisinnage utilise
- * @return /
- */
- public Grid (int gridWidth, int gridHeight, NeighborsType neighborsType) {
- super(gridWidth, gridHeight, neighborsType);
- // Auto-generated constructor stub
- }
-
- /**
- * Declaration + Initialisation de la grille avec les HSI de chaque cellule
- * Appelee lors de l'initialisation du programme
- * @param pilot
- * @return /
- */
- @InitTransientParameters
- public void initTransientParameters (Pilot pilot) throws FileNotFoundException {
-
- StringTokenizer sLigne;
- @SuppressWarnings("unused")
- double hsiStd = 0, hsiMoy = 0;
- int idCell = 0, yPike = 0, xPike = 0;
-
- // Declaration grille vide
- grid = new Cell[gridWidth * gridHeight];
-
- // Initialisation de toute la grille avec hsi = -1
- for (int cptCell = 0; cptCell < (gridWidth * gridHeight - 1); cptCell++) {
- grid[cptCell] = new Cell(cptCell, -1);
- }
-
- marnageInit = FichierMarnage.dateMarnage[Time.jourMois][Time.mois][Time.heure];
- if (marnageInit == null ) marnageInit = "513_4";
-
- // Lecture fichier contenant les HSI de toutes les mailles
- String filePath = "data/input/HSI/hsi_BRO" + Time.getSeason() + marnageInit + ".txt";
- Scanner scanner = new Scanner(new File(filePath));
-
- // Initialisation de chaque cellule contenant HSI
- // On boucle sur chaque ligne detectée
- String line = scanner.nextLine();
- while (scanner.hasNextLine()) {
- line = scanner.nextLine();
-
- // Decoupage ligne : id, hsiStd, hsiMoy
- sLigne = new StringTokenizer (line);
- if (sLigne.hasMoreTokens())
- idCell = Integer.parseInt(sLigne.nextToken())-1;
- if (sLigne.hasMoreTokens())
- hsiStd = Double.parseDouble(sLigne.nextToken());
- if (sLigne.hasMoreTokens())
- hsiMoy = Double.parseDouble(sLigne.nextToken());
-
- // Conversion idCell en coordonnees (x, y)
- // (x, y) avec les id de cellules de 0 à n-1
- yPike = (int) Math.floor(idCell / gridWidth);
- xPike = (int) idCell - (yPike * gridWidth);
-
- // Inversion des coordonnees en Y (place l'origine en bas à gauche)
- yPike = (gridHeight-1) - yPike ;
- // Conversion des coordonnees (x, y) en idCell
- idCell = xPike + yPike * gridWidth;
-
- // Initialisation du hsi de la cellule(idCell)
- grid[idCell] = new Cell(idCell, hsiMoy);
- }
- scanner.close(); // Fermeture du fichier
- }
-
- /**
- * Procedure qui definit la valeur du HSI pour une cellule
- * @param indexCell Indice de la cellule a traiter
- * @param hsiCell Valeur du HSI
- * @return /
- */
- public void setCell (int indexCell, double hsiCell) {
- grid[indexCell] = new Cell(indexCell, hsiCell);
- }
-
- /**
- * Procedure qui renvoie la grille actuelle
- * en cours de simulation
- * @param /
- * @return Grid Grille de la simulation
- */
- public Grid getGrid () {
- return this;
- }
-
- /**
- * Procedure qui ajoute un individu au groupe
- * d'individus aquaNism
- * @param ind L'individu a ajouter
- * @param group Groupe des individus
- * @return /
- */
- public void addAquaNism (Individual ind, AquaNismsGroup<?, ?> group) {
- super.addAquaNism(ind, group);
- ind.getPosition().addPike((Pike) ind);
- }
-
- /**
- * Procedure qui deplace un individu
- * @param ind L'individu a deplacer
- * @param group Groupe auquel appartient l'individu
- * @param dest Cellule de destination de l'individu
- * @return /
- */
- public void moveAquaNism (Individual ind, AquaNismsGroup<?, ?> group, Cell dest) {
- super.moveAquaNism(ind, group, dest);
- this.removeAquaNism(ind, group);
- dest.addPike((Pike) ind);
- }
-
- /**
- * Procedure qui enleve un individu
- * @param ind L'individu a enlever
- * @param group Groupe auquel appartient l'individu
- * @return /
- */
- public void removeAquaNism (Individual ind, AquaNismsGroup<?, ?> group) {
- super.removeAquaNism(ind, group);
- ind.getPosition().removePike((Pike) ind);
- }
-
- /**
- * Calcul des cellules accessibles (comprise dans le lac)
- * @param position ID de la cellule initiale
- * @return neighbours Liste des cellules (id) accessibles
- */
- public List<Cell> getNeighbours (Cell position) {
-
- List<Cell> neighbours = new ArrayList<Cell>();
- int[][] listeCoord;
- int xPike = 0, yPike = 0;
-
- // Calcul des coordonnees (x, y) a partir de l'Id de la maille
- yPike = (position.getIndex() / gridWidth);
- xPike = (position.getIndex() - (yPike * gridWidth));
-
- // Determination de la liste des mailles pour une distance donnee qui depend de la phase du jour et de la saison
- switch (Time.getSeason()) {
- case "PRINTEMPS": switch (Time.getPhaseJour()) {
- case "AUBE" : listeCoord = AreaMovement.areaPrinAube; break;
- case "JOUR" : listeCoord = AreaMovement.areaPrinJour; break;
- case "NUIT" : listeCoord = AreaMovement.areaPrinNuit; break;
- case "CREP" : listeCoord = AreaMovement.areaPrinCrep; break;
- default : System.out.println ("Erreur lecture de la Phase du Jour au Printemps");
- listeCoord = AreaMovement.areaPrinJour; break;
- } break;
-
- case "ETE" : switch (Time.getPhaseJour()) {
- case "AUBE" : listeCoord = AreaMovement.areaEteAube; break;
- case "JOUR" : listeCoord = AreaMovement.areaEteJour; break;
- case "NUIT" : listeCoord = AreaMovement.areaEteNuit; break;
- case "CREP" : listeCoord = AreaMovement.areaEteCrep; break;
- default : System.out.println ("Erreur lecture de la Phase du Jour en Ete");
- listeCoord = AreaMovement.areaEteJour; break;
- } break;
-
- case "AUTOMNE" : switch (Time.getPhaseJour()) {
- case "AUBE" : listeCoord = AreaMovement.areaAutAube; break;
- case "JOUR" : listeCoord = AreaMovement.areaAutJour; break;
- case "NUIT" : listeCoord = AreaMovement.areaAutNuit; break;
- case "CREP" : listeCoord = AreaMovement.areaAutCrep; break;
- default : System.out.println ("Erreur lecture de la Phase du Jour en Automne");
- listeCoord = AreaMovement.areaAutJour; break;
- } break;
-
- case "HIVER" : switch (Time.getPhaseJour()) {
- case "AUBE" : listeCoord = AreaMovement.areaHivAube; break;
- case "JOUR" : listeCoord = AreaMovement.areaHivJour; break;
- case "NUIT" : listeCoord = AreaMovement.areaHivNuit; break;
- case "CREP" : listeCoord = AreaMovement.areaHivCrep; break;
- default : System.out.println ("Erreur lecture de la Phase du Jour en Hiver");
- listeCoord = AreaMovement.areaHivJour; break;
- } break;
-
- default : System.out.println ("Erreur lecture de la Saison");
- switch (Time.getPhaseJour()) {
- case "AUBE" : listeCoord = AreaMovement.areaPrinAube; break;
- case "JOUR" : listeCoord = AreaMovement.areaPrinJour; break;
- case "NUIT" : listeCoord = AreaMovement.areaPrinNuit; break;
- case "CREP" : listeCoord = AreaMovement.areaPrinCrep; break;
- default : System.out.println ("Plus : Erreur lecture de la Phase du Jour");
- listeCoord = AreaMovement.areaPrinJour; break;
- } break;
- }
-
- // Calcul des mailles comprises dans le lac
- boolean stop = false;
- final int max = (gridWidth * gridHeight)-2;
- for (int cpt=0; cpt<listeCoord[0].length; cpt++) {
- int newCell = computeIndex(xPike, listeCoord, cpt, yPike);
-
- // Test si l'indice calcule appartient à la grille totale
- if (newCell >= 0 && newCell <= max) {
- final Cell cell = getCell(newCell);
- // Si l'indice calcule est compris dans le lac on l'ajoute a la liste
- if (cell.getHabitatQuality() >= 0) {
- neighbours.add(cell);
- }
- }
- }
- return neighbours;
- }
-
- private int computeIndex(int xPike, int[][] listeCoord, int cpt, int yPike) {
- return xPike + listeCoord[0][cpt] + (yPike + listeCoord[1][cpt]) * gridWidth;
- }
-}
+package pikelake;
+
+import java.io.File;
+import java.util.List;
+import java.util.Scanner;
+import java.util.ArrayList;
+import java.util.StringTokenizer;
+import java.io.FileNotFoundException;
+
+import pikelake.Cell;
+import pikelake.pikes.Pike;
+import pikelake.environment.Time;
+import pikelake.environment.AreaMovement;
+import pikelake.environment.FichierMarnage;
+
+import fr.cemagref.simaqualife.pilot.Pilot;
+import fr.cemagref.simaqualife.kernel.AquaNismsGroup;
+import fr.cemagref.simaqualife.extensions.spatial2D.Grid2D;
+import fr.cemagref.simaqualife.kernel.util.TransientParameters.InitTransientParameters;
+
+/**
+ * Classe qui initialise la grille de la simulation (lac et cellule non
+ * accessible)
+ *
+ * @author Guillaume GARBAY
+ * @version 1.0
+ */
+public class Grid extends Grid2D<Cell, Individual> {
+
+ private String marnageInit = "513_4";
+ private int cellnumber_2 = (gridWidth * gridHeight) - 2;
+
+ /**
+ * Constructeur de la classe Grid
+ *
+ * @param gridWidth Largeur totale de la grille
+ * @param gridHeight Longueur totale de la grille
+ * @param neighborsType Type de voisinnage utilise
+ * @return /
+ */
+ public Grid(int gridWidth, int gridHeight, NeighborsType neighborsType) {
+ super(gridWidth, gridHeight, neighborsType);
+ // Auto-generated constructor stub
+ }
+
+ /**
+ * Declaration + Initialisation de la grille avec les HSI de chaque cellule
+ * Appelee lors de l'initialisation du programme
+ *
+ * @param pilot
+ * @return /
+ */
+ @InitTransientParameters
+ public void initTransientParameters(Pilot pilot) throws FileNotFoundException {
+
+ StringTokenizer sLigne;
+ @SuppressWarnings("unused")
+ double hsiStd = 0, hsiMoy = 0;
+ int idCell = 0, yPike = 0, xPike = 0;
+
+ // Declaration grille vide
+ grid = new Cell[gridWidth * gridHeight];
+
+ // Initialisation de toute la grille avec hsi = -1
+ for (int cptCell = 0; cptCell < (gridWidth * gridHeight - 1); cptCell++) {
+ grid[cptCell] = new Cell(cptCell, -1);
+ }
+
+ marnageInit = FichierMarnage.dateMarnage[Time.jourMois][Time.mois][Time.heure];
+ if (marnageInit == null) {
+ marnageInit = "513_4";
+ }
+
+ // Lecture fichier contenant les HSI de toutes les mailles
+ String filePath = "data/input/HSI/hsi_BRO" + Time.getSeason() + marnageInit + ".txt";
+ Scanner scanner = new Scanner(new File(filePath));
+
+ // Initialisation de chaque cellule contenant HSI
+ // On boucle sur chaque ligne detectée
+ String line = scanner.nextLine();
+ while (scanner.hasNextLine()) {
+ line = scanner.nextLine();
+
+ // Decoupage ligne : id, hsiStd, hsiMoy
+ sLigne = new StringTokenizer(line);
+ if (sLigne.hasMoreTokens()) {
+ idCell = Integer.parseInt(sLigne.nextToken()) - 1;
+ }
+ if (sLigne.hasMoreTokens()) {
+ hsiStd = Double.parseDouble(sLigne.nextToken());
+ }
+ if (sLigne.hasMoreTokens()) {
+ hsiMoy = Double.parseDouble(sLigne.nextToken());
+ }
+
+ // Conversion idCell en coordonnees (x, y)
+ // (x, y) avec les id de cellules de 0 à n-1
+ yPike = (int) Math.floor(idCell / gridWidth);
+ xPike = (int) idCell - (yPike * gridWidth);
+
+ // Inversion des coordonnees en Y (place l'origine en bas à gauche)
+ yPike = (gridHeight - 1) - yPike;
+ // Conversion des coordonnees (x, y) en idCell
+ idCell = xPike + yPike * gridWidth;
+
+ // Initialisation du hsi de la cellule(idCell)
+ grid[idCell] = new Cell(idCell, hsiMoy);
+ }
+ scanner.close(); // Fermeture du fichier
+ }
+
+ /**
+ * Procedure qui definit la valeur du HSI pour une cellule
+ *
+ * @param indexCell Indice de la cellule a traiter
+ * @param hsiCell Valeur du HSI
+ * @return /
+ */
+ public void setCell(int indexCell, double hsiCell) {
+ grid[indexCell] = new Cell(indexCell, hsiCell);
+ }
+
+ /**
+ * Procedure qui renvoie la grille actuelle en cours de simulation
+ *
+ * @param /
+ * @return Grid Grille de la simulation
+ */
+ public Grid getGrid() {
+ return this;
+ }
+
+ /**
+ * Procedure qui ajoute un individu au groupe d'individus aquaNism
+ *
+ * @param ind L'individu a ajouter
+ * @param group Groupe des individus
+ * @return /
+ */
+ public void addAquaNism(Individual ind, AquaNismsGroup<?, ?> group) {
+ super.addAquaNism(ind, group);
+ ind.getPosition().addPike((Pike) ind);
+ }
+
+ /**
+ * Procedure qui deplace un individu
+ *
+ * @param ind L'individu a deplacer
+ * @param group Groupe auquel appartient l'individu
+ * @param dest Cellule de destination de l'individu
+ * @return /
+ */
+ public void moveAquaNism(Individual ind, AquaNismsGroup<?, ?> group, Cell dest) {
+ super.moveAquaNism(ind, group, dest);
+ this.removeAquaNism(ind, group);
+ dest.addPike((Pike) ind);
+ }
+
+ /**
+ * Procedure qui enleve un individu
+ *
+ * @param ind L'individu a enlever
+ * @param group Groupe auquel appartient l'individu
+ * @return /
+ */
+ public void removeAquaNism(Individual ind, AquaNismsGroup<?, ?> group) {
+ super.removeAquaNism(ind, group);
+ ind.getPosition().removePike((Pike) ind);
+ }
+
+ /**
+ * Calcul des cellules accessibles (comprise dans le lac)
+ *
+ * @param position ID de la cellule initiale
+ * @return neighbours Liste des cellules (id) accessibles
+ */
+ public List<Cell> getNeighbours(Cell position) {
+
+ List<Cell> neighbours = new ArrayList<Cell>();
+ int[][] listeCoord;
+ int xPike = 0, yPike = 0;
+
+ // Calcul des coordonnees (x, y) a partir de l'Id de la maille
+ yPike = (position.getIndex() / gridWidth);
+ xPike = (position.getIndex() - (yPike * gridWidth));
+
+ // Determination de la liste des mailles pour une distance donnee qui depend de la phase du jour et de la saison
+ switch (Time.getSeason()) {
+ case "PRINTEMPS":
+ switch (Time.getPhaseJour()) {
+ case "AUBE":
+ listeCoord = AreaMovement.areaPrinAube;
+ break;
+ case "JOUR":
+ listeCoord = AreaMovement.areaPrinJour;
+ break;
+ case "NUIT":
+ listeCoord = AreaMovement.areaPrinNuit;
+ break;
+ case "CREP":
+ listeCoord = AreaMovement.areaPrinCrep;
+ break;
+ default:
+ System.out.println("Erreur lecture de la Phase du Jour au Printemps");
+ listeCoord = AreaMovement.areaPrinJour;
+ break;
+ }
+ break;
+
+ case "ETE":
+ switch (Time.getPhaseJour()) {
+ case "AUBE":
+ listeCoord = AreaMovement.areaEteAube;
+ break;
+ case "JOUR":
+ listeCoord = AreaMovement.areaEteJour;
+ break;
+ case "NUIT":
+ listeCoord = AreaMovement.areaEteNuit;
+ break;
+ case "CREP":
+ listeCoord = AreaMovement.areaEteCrep;
+ break;
+ default:
+ System.out.println("Erreur lecture de la Phase du Jour en Ete");
+ listeCoord = AreaMovement.areaEteJour;
+ break;
+ }
+ break;
+
+ case "AUTOMNE":
+ switch (Time.getPhaseJour()) {
+ case "AUBE":
+ listeCoord = AreaMovement.areaAutAube;
+ break;
+ case "JOUR":
+ listeCoord = AreaMovement.areaAutJour;
+ break;
+ case "NUIT":
+ listeCoord = AreaMovement.areaAutNuit;
+ break;
+ case "CREP":
+ listeCoord = AreaMovement.areaAutCrep;
+ break;
+ default:
+ System.out.println("Erreur lecture de la Phase du Jour en Automne");
+ listeCoord = AreaMovement.areaAutJour;
+ break;
+ }
+ break;
+
+ case "HIVER":
+ switch (Time.getPhaseJour()) {
+ case "AUBE":
+ listeCoord = AreaMovement.areaHivAube;
+ break;
+ case "JOUR":
+ listeCoord = AreaMovement.areaHivJour;
+ break;
+ case "NUIT":
+ listeCoord = AreaMovement.areaHivNuit;
+ break;
+ case "CREP":
+ listeCoord = AreaMovement.areaHivCrep;
+ break;
+ default:
+ System.out.println("Erreur lecture de la Phase du Jour en Hiver");
+ listeCoord = AreaMovement.areaHivJour;
+ break;
+ }
+ break;
+
+ default:
+ System.out.println("Erreur lecture de la Saison");
+ switch (Time.getPhaseJour()) {
+ case "AUBE":
+ listeCoord = AreaMovement.areaPrinAube;
+ break;
+ case "JOUR":
+ listeCoord = AreaMovement.areaPrinJour;
+ break;
+ case "NUIT":
+ listeCoord = AreaMovement.areaPrinNuit;
+ break;
+ case "CREP":
+ listeCoord = AreaMovement.areaPrinCrep;
+ break;
+ default:
+ System.out.println("Plus : Erreur lecture de la Phase du Jour");
+ listeCoord = AreaMovement.areaPrinJour;
+ break;
+ }
+ break;
+ }
+
+ // Calcul des mailles comprises dans le lac
+ boolean stop = false;
+ Cell cellule = null;
+ for (int cpt = 0; cpt < listeCoord[0].length; cpt++) {
+
+ if (listeCoord[0][cpt] == 0 && listeCoord[1][cpt] == 0 && stop == true) {
+ break;
+ }
+ if (listeCoord[0][cpt] == 0 && listeCoord[1][cpt] == 0) {
+ stop = true;
+ }
+
+ // Calcul de l'indice de la maille à partir des coordonnees (x,y)
+ int newCell = xPike + listeCoord[0][cpt] + (yPike + listeCoord[1][cpt]) * gridWidth;
+
+ // Test si l'indice calcule appartient à la grille totale
+ if (newCell >= 0 && newCell <= cellnumber_2) {
+ cellule = getCell(newCell);
+ // Si l'indice calcule est compris dans le lac on l'ajoute a la liste
+ if (cellule.getHabitatQuality() >= 0) {
+ neighbours.add(cellule);
+ }
+ }
+ }
+ return neighbours;
+ }
+
+ private int computeIndex(int xPike, int[][] listeCoord, int cpt, int yPike) {
+ return xPike + listeCoord[0][cpt] + (yPike + listeCoord[1][cpt]) * gridWidth;
+ }
+}
--
GitLab